Nie możesz wybrać więcej, niż 25 tematów
Tematy muszą się zaczynać od litery lub cyfry, mogą zawierać myślniki ('-') i mogą mieć do 35 znaków.
YaqingLiu
a8bce51877
docs: README.md
|
2 lat temu | |
|---|---|---|
| tasks | 2 lat temu | |
| .gitignore | 2 lat temu | |
| LICENSE | 2 lat temu | |
| README.md | 2 lat temu | |
| defaults | 2 lat temu | |
| inputs | 2 lat temu | |
| workflow.wdl | 2 lat temu | |
README.md
WES analysis
Automated integrated analysis software for genomics data of the cancer patients.
Quality control
FastQC, FastQ Screen, Qualimap
Variant calling
- SNV/Indel: TNseq (somatic), Haplotyper (germline)
- CNV: CNVkit
- SV: Manta
- TMB: in-house code
- HRD: sequenza
- MSI: MSIsensor