YaqingLiu
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Mis à jour il y a 1 an

WesPipe
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Automated integrated analysis software for genomics data of the cancer patients.

Mis à jour il y a 2 ans

WesPipe-hg19-bam
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WesPipe-hg19
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CNVkit-test
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Mis à jour il y a 2 ans

AnnotSV
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Mis à jour il y a 2 ans

rmsk
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Mis à jour il y a 3 ans

ANNOVAR
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Annotation of genetic variants detected from human genome hg19 and hg38.

Mis à jour il y a 3 ans

VEP
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VEP (Variant Effect Predictor) predicts the functional effects of genomic variants. The annotated VCF will be converted into MAF based on vcf2maf.

Mis à jour il y a 3 ans

variant-calling
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Germline & Somatic short variant discovery (SNVs + Indels) for WGS & WES.

Mis à jour il y a 3 ans

bcftools-merge
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bcftools-merge is used to merge VCF files into a singe VCF.

Mis à jour il y a 3 ans

arriba3
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Mis à jour il y a 3 ans