renluyao
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variant-calling
forkato da YaqingLiu/variant-calling
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87 Commit
1 Ramo (Branch)
Albero (Tree): 55e4232daa
Rami (Branch) Tag
${ item.name }
Crea branch ${ searchTerm }
da '55e4232daa'
${ noResults }
Grafico dei commit

87 Commit (55e4232daae9671fea321ac7b3b8df741412fe93)
 

Autore SHA1 Messaggio Data
  YaqingLiu 55e4232daa Fixbug: input_fastq and input_bam 3 anni fa
  YaqingLiu 831fa1b007 Alter: varscan_vep input name 3 anni fa
  YaqingLiu 9a3ce1ee23 Alter: VEP task name 3 anni fa
  YaqingLiu 9e1ac3e469 Alter: BQSR 3 anni fa
  YaqingLiu 7868563c2a Fixbug: ANNOVAR 3 anni fa
  YaqingLiu 33b1c80f3e test bam input 3 anni fa
  YaqingLiu cb2cc7173e test add bam 3 anni fa
  YaqingLiu fa7bbf3d1d Update: README 4 anni fa
  YaqingLiu 470d220762 Update: README 4 anni fa
  YaqingLiu 270b9d1ac0 Update: README 4 anni fa
  YaqingLiu 3960b57b2b Update: README 4 anni fa
  YaqingLiu 01d17edd41 Update: README 4 anni fa
  YaqingLiu 607454ab2f Update: add VEP 4 anni fa
  YaqingLiu dbd1da94c2 Update: add PASS filter option 4 anni fa
  YaqingLiu 3a2e5030af Update ANNOVAR.wdl filename 4 anni fa
  YaqingLiu d925a41571 Update: ANNOVAR 4 anni fa
  YaqingLiu fef526105b Add TNseq output 4 anni fa
  YaqingLiu 440fc0d224 Add annovar parameter 4 anni fa
  YaqingLiu ef82cc2a54 Fixbug: output of annovar 4 anni fa
  YaqingLiu a2064698dc Fixbug: output of annovar 4 anni fa
  YaqingLiu f3928d598e Update: default interval_padding is 0 4 anni fa
  YaqingLiu 6d4d6abe80 Update: simplify BQSR 4 anni fa
  YaqingLiu eab87988a1 Alter: Varscan2 input is deduped BAM 4 anni fa
  YaqingLiu e8f07a8c53 Alter: TNseq input is deduped BAM 4 anni fa
  YaqingLiu d1faa18e02 Alter: TNseq Input 4 anni fa
  YaqingLiu 03fb6ee728 Update: defaults 4 anni fa
  YaqingLiu 568b2547c3 Update: defaults 4 anni fa
  YaqingLiu 7e612b6ddd Fix bug: merge Varscan's results 4 anni fa
  YaqingLiu cb6332a576 Update: varscan somatic annovar 4 anni fa
  YaqingLiu a06abfc5cf Update: varscan 4 anni fa
  YaqingLiu 96a3c5dc5d Update: annovar.wdl, remove ensGene and knownGene 4 anni fa
  YaqingLiu 09955be90c Update: default sentieon version 4 anni fa
  YaqingLiu 61c1a9944f Update: README.md 4 anni fa
  YaqingLiu 4c099f39b6 Update: README.md 4 anni fa
  YaqingLiu d132679ec2 update default 4 anni fa
  YaqingLiu 4ce53ad6c6 Fix bug: TNscope.wdl 4 anni fa
  YaqingLiu af9561b1e0 Fix bug: BQSR.wdl 4 anni fa
  YaqingLiu 59b2e9cb84 Fix bug: Realigner's inputs 4 anni fa
  YaqingLiu ed468bfd8e Fix bug: TNseq.wdl 4 anni fa
  YaqingLiu a6057601d2 Fix bug: BQSR.wdl 4 anni fa
  YaqingLiu fe662a3686 Fix bug: TNseq.wdl 4 anni fa
  YaqingLiu e1902ce785 Update: default interval_padding 4 anni fa
  YaqingLiu 09159a19f9 Update: README.md 4 anni fa
  YaqingLiu ab4b741af9 Fix bug: germline 4 anni fa
  YaqingLiu 784f19e2c9 Fix bug: remove vcf2maf 4 anni fa
  YaqingLiu 02f79915c3 Fix bug: remove vcf2maf 4 anni fa
  YaqingLiu 693a6bc34b Fix bug: Haplotyper 4 anni fa
  YaqingLiu 193d7a3bf4 Update: inputs 4 anni fa
  YaqingLiu 979513f14c Update: inputs 4 anni fa
  YaqingLiu 1dd6c6016d Update: inputs 4 anni fa