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variant-calling
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95 Commits
1 Branch
Struktur: 7e4d99c1a7
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Erstelle Branch ${ searchTerm }
von „7e4d99c1a7“
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95 Commits (7e4d99c1a7598086f306717f52f488350007bd5c)
 

Autor SHA1 Nachricht Datum
  YaqingLiu 7e4d99c1a7 Add: replaceRG vor 3 Jahren
  YaqingLiu fe311d4483 Fixbug: remove vor 3 Jahren
  YaqingLiu 6899365543 Fixbug: defaults vor 3 Jahren
  YaqingLiu 212b5c40df Fixbug: TNseq output vor 3 Jahren
  YaqingLiu fe6512cce0 Fixbug: TNseq output vor 3 Jahren
  YaqingLiu 71cb524380 Fixbug: TNseq output vor 3 Jahren
  YaqingLiu b124b6d8d0 Fixbug: TNseq vor 3 Jahren
  YaqingLiu dbce0e5ce4 Alter: tumor-only vor 3 Jahren
  YaqingLiu 55e4232daa Fixbug: input_fastq and input_bam vor 3 Jahren
  YaqingLiu 831fa1b007 Alter: varscan_vep input name vor 3 Jahren
  YaqingLiu 9a3ce1ee23 Alter: VEP task name vor 3 Jahren
  YaqingLiu 9e1ac3e469 Alter: BQSR vor 3 Jahren
  YaqingLiu 7868563c2a Fixbug: ANNOVAR vor 3 Jahren
  YaqingLiu 33b1c80f3e test bam input vor 3 Jahren
  YaqingLiu cb2cc7173e test add bam vor 3 Jahren
  YaqingLiu fa7bbf3d1d Update: README vor 4 Jahren
  YaqingLiu 470d220762 Update: README vor 4 Jahren
  YaqingLiu 270b9d1ac0 Update: README vor 4 Jahren
  YaqingLiu 3960b57b2b Update: README vor 4 Jahren
  YaqingLiu 01d17edd41 Update: README vor 4 Jahren
  YaqingLiu 607454ab2f Update: add VEP vor 4 Jahren
  YaqingLiu dbd1da94c2 Update: add PASS filter option vor 4 Jahren
  YaqingLiu 3a2e5030af Update ANNOVAR.wdl filename vor 4 Jahren
  YaqingLiu d925a41571 Update: ANNOVAR vor 4 Jahren
  YaqingLiu fef526105b Add TNseq output vor 4 Jahren
  YaqingLiu 440fc0d224 Add annovar parameter vor 4 Jahren
  YaqingLiu ef82cc2a54 Fixbug: output of annovar vor 4 Jahren
  YaqingLiu a2064698dc Fixbug: output of annovar vor 4 Jahren
  YaqingLiu f3928d598e Update: default interval_padding is 0 vor 4 Jahren
  YaqingLiu 6d4d6abe80 Update: simplify BQSR vor 4 Jahren
  YaqingLiu eab87988a1 Alter: Varscan2 input is deduped BAM vor 4 Jahren
  YaqingLiu e8f07a8c53 Alter: TNseq input is deduped BAM vor 4 Jahren
  YaqingLiu d1faa18e02 Alter: TNseq Input vor 4 Jahren
  YaqingLiu 03fb6ee728 Update: defaults vor 4 Jahren
  YaqingLiu 568b2547c3 Update: defaults vor 4 Jahren
  YaqingLiu 7e612b6ddd Fix bug: merge Varscan's results vor 4 Jahren
  YaqingLiu cb6332a576 Update: varscan somatic annovar vor 4 Jahren
  YaqingLiu a06abfc5cf Update: varscan vor 4 Jahren
  YaqingLiu 96a3c5dc5d Update: annovar.wdl, remove ensGene and knownGene vor 4 Jahren
  YaqingLiu 09955be90c Update: default sentieon version vor 4 Jahren
  YaqingLiu 61c1a9944f Update: README.md vor 4 Jahren
  YaqingLiu 4c099f39b6 Update: README.md vor 4 Jahren
  YaqingLiu d132679ec2 update default vor 4 Jahren
  YaqingLiu 4ce53ad6c6 Fix bug: TNscope.wdl vor 4 Jahren
  YaqingLiu af9561b1e0 Fix bug: BQSR.wdl vor 4 Jahren
  YaqingLiu 59b2e9cb84 Fix bug: Realigner's inputs vor 4 Jahren
  YaqingLiu ed468bfd8e Fix bug: TNseq.wdl vor 4 Jahren
  YaqingLiu a6057601d2 Fix bug: BQSR.wdl vor 4 Jahren
  YaqingLiu fe662a3686 Fix bug: TNseq.wdl vor 4 Jahren
  YaqingLiu e1902ce785 Update: default interval_padding vor 4 Jahren