YaqingLiu пре 2 година
родитељ
комит
f592faa5a9
1 измењених фајлова са 3 додато и 1 уклоњено
  1. +3
    -1
      tasks/bcftools.wdl

+ 3
- 1
tasks/bcftools.wdl Прегледај датотеку

@@ -13,7 +13,9 @@ task bcftools {
set -e
nt=$(nproc)
bcftools norm -m -both ${vcf} | bcftools norm -f ${ref_dir}/${fasta} -Ov -o ${basename}.norm.vcf
# bcftools norm -m -both ${vcf} | bcftools norm -f ${ref_dir}/${fasta} -Ov -o ${basename}.norm.vcf
# Split multiallelic sites
bcftools norm -m -both ${vcf} -o ${basename}.norm.vcf
>>>
runtime {

Loading…
Откажи
Сачувај