Переглянути джерело

Fixbug: can't find bcftools

master
YaqingLiu 3 роки тому
джерело
коміт
4723fd6102
1 змінених файлів з 2 додано та 0 видалено
  1. +2
    -0
      tasks/VEP.wdl

+ 2
- 0
tasks/VEP.wdl Переглянути файл

@@ -22,6 +22,8 @@ task VEP {
set -e
nt=$(nproc)

source /etc/profile

awk -F'\t' '{if(($1~"^#")||($1!~"^#" && $7=="PASS")){print $0}}' ${vcf} > ${sample_id}.vcf
# Judge the SAMPLE info of vcf file

Завантаження…
Відмінити
Зберегти