Просмотр исходного кода

Fixbug: can't find bcftools

master
YaqingLiu 3 лет назад
Родитель
Сommit
4723fd6102
1 измененных файлов: 2 добавлений и 0 удалений
  1. +2
    -0
      tasks/VEP.wdl

+ 2
- 0
tasks/VEP.wdl Просмотреть файл

@@ -22,6 +22,8 @@ task VEP {
set -e
nt=$(nproc)

source /etc/profile

awk -F'\t' '{if(($1~"^#")||($1!~"^#" && $7=="PASS")){print $0}}' ${vcf} > ${sample_id}.vcf
# Judge the SAMPLE info of vcf file

Загрузка…
Отмена
Сохранить