Šī lapa labāk darbojas, ja pārlūkam ir iespējots JavaScript.
Sākums
Izpētīt
Drone
Palīdzība
Pierakstīties
YaqingLiu
/
VEP
Vērot
1
Pievienot zvaigznīti
0
Atdalīts
0
Kods
Problēmas
0
Izmaiņu pieprasījumi
0
Laidieni
0
Vikivietne
Aktivitāte
Pārlūkot izejas kodu
Fixbug: can't find bcftools
master
YaqingLiu
pirms 3 gadiem
vecāks
63da359fd2
revīzija
4723fd6102
1 mainītis faili
ar
2 papildinājumiem
un
0 dzēšanām
Dalītais skats
Diff Options
Show Stats
Download Patch File
Download Diff File
+2
-0
tasks/VEP.wdl
+ 2
- 0
tasks/VEP.wdl
Parādīt failu
@@ -22,6 +22,8 @@ task VEP {
set -e
nt=$(nproc)
source /etc/profile
awk -F'\t' '{if(($1~"^#")||($1!~"^#" && $7=="PASS")){print $0}}' ${vcf} > ${sample_id}.vcf
# Judge the SAMPLE info of vcf file
Rakstīt
Priekšskatītījums
Notiek ielāde…
Atcelt
Saglabāt