Преглед на файлове

Fixbug: can't find bcftools

master
YaqingLiu преди 3 години
родител
ревизия
4723fd6102
променени са 1 файла, в които са добавени 2 реда и са изтрити 0 реда
  1. +2
    -0
      tasks/VEP.wdl

+ 2
- 0
tasks/VEP.wdl Целия файл

@@ -22,6 +22,8 @@ task VEP {
set -e
nt=$(nproc)

source /etc/profile

awk -F'\t' '{if(($1~"^#")||($1!~"^#" && $7=="PASS")){print $0}}' ${vcf} > ${sample_id}.vcf
# Judge the SAMPLE info of vcf file

Loading…
Отказ
Запис