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Fixbug: can't find bcftools

master
YaqingLiu vor 3 Jahren
Ursprung
Commit
4723fd6102
1 geänderte Dateien mit 2 neuen und 0 gelöschten Zeilen
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      tasks/VEP.wdl

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tasks/VEP.wdl Datei anzeigen

@@ -22,6 +22,8 @@ task VEP {
set -e
nt=$(nproc)

source /etc/profile

awk -F'\t' '{if(($1~"^#")||($1!~"^#" && $7=="PASS")){print $0}}' ${vcf} > ${sample_id}.vcf
# Judge the SAMPLE info of vcf file

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