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variant-calling
bifurqué depuis YaqingLiu/variant-calling
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117 Révisions
1 Branche
Aborescence: df1c66f195
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Créer la branche ${ searchTerm }
de 'df1c66f195'
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Graphique des révisions

117 Révisions (df1c66f195c5953f3b09ab4055972c44c8a0aea2)
 

Auteur SHA1 Message Date
  YaqingLiu df1c66f195 Update: remove only_pass il y a 3 ans
  YaqingLiu e8269dd25f Update: annovar il y a 3 ans
  YaqingLiu d7acaa8040 Update: replaceRG il y a 3 ans
  YaqingLiu aea00bb6e0 Update: README il y a 3 ans
  YaqingLiu 1819c0a4f6 Update: threads in Pindel il y a 3 ans
  YaqingLiu af26391dd8 Fixbug: insert size in Pindel il y a 3 ans
  YaqingLiu 024d9b4281 update README il y a 3 ans
  YaqingLiu 3accc366b6 update workflow il y a 3 ans
  YaqingLiu f4279ccb13 Update: workflow operator il y a 3 ans
  YaqingLiu d064f8f055 Update: workflow il y a 3 ans
  YaqingLiu 4975096286 Alter varscan Xmx16g il y a 3 ans
  YaqingLiu 13bc0462c9 Update: samtools dir il y a 3 ans
  YaqingLiu 56f48cd21f Update: samtools_docker version il y a 3 ans
  YaqingLiu 61ae02ea72 Update: samtools_docker version il y a 3 ans
  YaqingLiu f515625972 Fixbug: samtools index il y a 3 ans
  YaqingLiu c72f3aae8c Fixbug: replaceRG input il y a 3 ans
  YaqingLiu 5e46d8aee0 Fixbug: task's name il y a 3 ans
  YaqingLiu cd5f5ba56b Fixbug: pindel task name il y a 3 ans
  YaqingLiu 19a6548af2 Fixbug: add pindel Boolean il y a 3 ans
  YaqingLiu a36b68f093 Fixbug: $ in pindel il y a 3 ans
  YaqingLiu d2988bab5d Fixbug: cluster: cluster_config il y a 3 ans
  YaqingLiu 29053d0d19 Alter: replaceRG output il y a 3 ans
  YaqingLiu 7e4d99c1a7 Add: replaceRG il y a 3 ans
  YaqingLiu fe311d4483 Fixbug: remove il y a 3 ans
  YaqingLiu 6899365543 Fixbug: defaults il y a 3 ans
  YaqingLiu 212b5c40df Fixbug: TNseq output il y a 3 ans
  YaqingLiu fe6512cce0 Fixbug: TNseq output il y a 3 ans
  YaqingLiu 71cb524380 Fixbug: TNseq output il y a 3 ans
  YaqingLiu b124b6d8d0 Fixbug: TNseq il y a 3 ans
  YaqingLiu dbce0e5ce4 Alter: tumor-only il y a 3 ans
  YaqingLiu 55e4232daa Fixbug: input_fastq and input_bam il y a 3 ans
  YaqingLiu 831fa1b007 Alter: varscan_vep input name il y a 3 ans
  YaqingLiu 9a3ce1ee23 Alter: VEP task name il y a 3 ans
  YaqingLiu 9e1ac3e469 Alter: BQSR il y a 3 ans
  YaqingLiu 7868563c2a Fixbug: ANNOVAR il y a 3 ans
  YaqingLiu 33b1c80f3e test bam input il y a 3 ans
  YaqingLiu cb2cc7173e test add bam il y a 3 ans
  YaqingLiu fa7bbf3d1d Update: README il y a 4 ans
  YaqingLiu 470d220762 Update: README il y a 4 ans
  YaqingLiu 270b9d1ac0 Update: README il y a 4 ans
  YaqingLiu 3960b57b2b Update: README il y a 4 ans
  YaqingLiu 01d17edd41 Update: README il y a 4 ans
  YaqingLiu 607454ab2f Update: add VEP il y a 4 ans
  YaqingLiu dbd1da94c2 Update: add PASS filter option il y a 4 ans
  YaqingLiu 3a2e5030af Update ANNOVAR.wdl filename il y a 4 ans
  YaqingLiu d925a41571 Update: ANNOVAR il y a 4 ans
  YaqingLiu fef526105b Add TNseq output il y a 4 ans
  YaqingLiu 440fc0d224 Add annovar parameter il y a 4 ans
  YaqingLiu ef82cc2a54 Fixbug: output of annovar il y a 4 ans
  YaqingLiu a2064698dc Fixbug: output of annovar il y a 4 ans