Tämä sivusto toimii paremmin JavaScriptillä.
Etusivu
Tutki
Drone
Apua
Kirjaudu sisään
renluyao
/
variant-calling
forkattu lähteestä
YaqingLiu/variant-calling
Tarkkaile
1
Äänestä
0
Fork
0
Koodi
Ongelmat
0
Pull-pyynnöt
0
Julkaisut
0
Wiki
Activity
118
Commitit
1
Haara
Puu:
c59e589713
master
v0.1.3
v0.1.2
v0.1.0
Branchit
Tagit
${ item.name }
Create branch
${ searchTerm }
from 'c59e589713'
${ noResults }
Commit Graph
61 Commitit (c59e589713a8da873be3e90bfcf09201ea645d2d)
Tekijä
SHA1
Viesti
Päivämäärä
YaqingLiu
c59e589713
Update: java Xmx32g
3 vuotta sitten
YaqingLiu
df1c66f195
Update: remove only_pass
3 vuotta sitten
YaqingLiu
e8269dd25f
Update: annovar
3 vuotta sitten
YaqingLiu
d7acaa8040
Update: replaceRG
3 vuotta sitten
YaqingLiu
1819c0a4f6
Update: threads in Pindel
3 vuotta sitten
YaqingLiu
af26391dd8
Fixbug: insert size in Pindel
3 vuotta sitten
YaqingLiu
3accc366b6
update workflow
3 vuotta sitten
YaqingLiu
d064f8f055
Update: workflow
3 vuotta sitten
YaqingLiu
4975096286
Alter varscan Xmx16g
3 vuotta sitten
YaqingLiu
13bc0462c9
Update: samtools dir
3 vuotta sitten
YaqingLiu
f515625972
Fixbug: samtools index
3 vuotta sitten
YaqingLiu
5e46d8aee0
Fixbug: task's name
3 vuotta sitten
YaqingLiu
cd5f5ba56b
Fixbug: pindel task name
3 vuotta sitten
YaqingLiu
a36b68f093
Fixbug: $ in pindel
3 vuotta sitten
YaqingLiu
d2988bab5d
Fixbug: cluster: cluster_config
3 vuotta sitten
YaqingLiu
29053d0d19
Alter: replaceRG output
3 vuotta sitten
YaqingLiu
7e4d99c1a7
Add: replaceRG
3 vuotta sitten
YaqingLiu
fe311d4483
Fixbug: remove
3 vuotta sitten
YaqingLiu
212b5c40df
Fixbug: TNseq output
3 vuotta sitten
YaqingLiu
fe6512cce0
Fixbug: TNseq output
3 vuotta sitten
YaqingLiu
71cb524380
Fixbug: TNseq output
3 vuotta sitten
YaqingLiu
b124b6d8d0
Fixbug: TNseq
3 vuotta sitten
YaqingLiu
dbce0e5ce4
Alter: tumor-only
3 vuotta sitten
YaqingLiu
9a3ce1ee23
Alter: VEP task name
3 vuotta sitten
YaqingLiu
9e1ac3e469
Alter: BQSR
3 vuotta sitten
YaqingLiu
7868563c2a
Fixbug: ANNOVAR
3 vuotta sitten
YaqingLiu
607454ab2f
Update: add VEP
4 vuotta sitten
YaqingLiu
dbd1da94c2
Update: add PASS filter option
4 vuotta sitten
YaqingLiu
3a2e5030af
Update ANNOVAR.wdl filename
4 vuotta sitten
YaqingLiu
d925a41571
Update: ANNOVAR
4 vuotta sitten
YaqingLiu
fef526105b
Add TNseq output
4 vuotta sitten
YaqingLiu
440fc0d224
Add annovar parameter
4 vuotta sitten
YaqingLiu
a2064698dc
Fixbug: output of annovar
4 vuotta sitten
YaqingLiu
6d4d6abe80
Update: simplify BQSR
4 vuotta sitten
YaqingLiu
e8f07a8c53
Alter: TNseq input is deduped BAM
4 vuotta sitten
YaqingLiu
d1faa18e02
Alter: TNseq Input
4 vuotta sitten
YaqingLiu
03fb6ee728
Update: defaults
4 vuotta sitten
YaqingLiu
7e612b6ddd
Fix bug: merge Varscan's results
4 vuotta sitten
YaqingLiu
cb6332a576
Update: varscan somatic annovar
4 vuotta sitten
YaqingLiu
a06abfc5cf
Update: varscan
4 vuotta sitten
YaqingLiu
96a3c5dc5d
Update: annovar.wdl, remove ensGene and knownGene
4 vuotta sitten
YaqingLiu
4ce53ad6c6
Fix bug: TNscope.wdl
4 vuotta sitten
YaqingLiu
af9561b1e0
Fix bug: BQSR.wdl
4 vuotta sitten
YaqingLiu
ed468bfd8e
Fix bug: TNseq.wdl
4 vuotta sitten
YaqingLiu
a6057601d2
Fix bug: BQSR.wdl
4 vuotta sitten
YaqingLiu
fe662a3686
Fix bug: TNseq.wdl
4 vuotta sitten
YaqingLiu
09159a19f9
Update: README.md
4 vuotta sitten
YaqingLiu
693a6bc34b
Fix bug: Haplotyper
4 vuotta sitten
YaqingLiu
eb14b9b267
Update: inputs
4 vuotta sitten
YaqingLiu
d73e139d63
Update: inputs
4 vuotta sitten
Ensimmäinen
Edellinen
1
2
Seuraava
Viimeisin