110 Commits (3accc366b64b6c5a71b7dd811b38079cd039cacb)
 

Autor SHA1 Nachricht Datum
  YaqingLiu 3accc366b6 update workflow vor 3 Jahren
  YaqingLiu f4279ccb13 Update: workflow operator vor 3 Jahren
  YaqingLiu d064f8f055 Update: workflow vor 3 Jahren
  YaqingLiu 4975096286 Alter varscan Xmx16g vor 3 Jahren
  YaqingLiu 13bc0462c9 Update: samtools dir vor 3 Jahren
  YaqingLiu 56f48cd21f Update: samtools_docker version vor 3 Jahren
  YaqingLiu 61ae02ea72 Update: samtools_docker version vor 3 Jahren
  YaqingLiu f515625972 Fixbug: samtools index vor 3 Jahren
  YaqingLiu c72f3aae8c Fixbug: replaceRG input vor 3 Jahren
  YaqingLiu 5e46d8aee0 Fixbug: task's name vor 3 Jahren
  YaqingLiu cd5f5ba56b Fixbug: pindel task name vor 3 Jahren
  YaqingLiu 19a6548af2 Fixbug: add pindel Boolean vor 3 Jahren
  YaqingLiu a36b68f093 Fixbug: $ in pindel vor 3 Jahren
  YaqingLiu d2988bab5d Fixbug: cluster: cluster_config vor 3 Jahren
  YaqingLiu 29053d0d19 Alter: replaceRG output vor 3 Jahren
  YaqingLiu 7e4d99c1a7 Add: replaceRG vor 3 Jahren
  YaqingLiu fe311d4483 Fixbug: remove vor 3 Jahren
  YaqingLiu 6899365543 Fixbug: defaults vor 3 Jahren
  YaqingLiu 212b5c40df Fixbug: TNseq output vor 3 Jahren
  YaqingLiu fe6512cce0 Fixbug: TNseq output vor 3 Jahren
  YaqingLiu 71cb524380 Fixbug: TNseq output vor 3 Jahren
  YaqingLiu b124b6d8d0 Fixbug: TNseq vor 3 Jahren
  YaqingLiu dbce0e5ce4 Alter: tumor-only vor 3 Jahren
  YaqingLiu 55e4232daa Fixbug: input_fastq and input_bam vor 3 Jahren
  YaqingLiu 831fa1b007 Alter: varscan_vep input name vor 3 Jahren
  YaqingLiu 9a3ce1ee23 Alter: VEP task name vor 3 Jahren
  YaqingLiu 9e1ac3e469 Alter: BQSR vor 3 Jahren
  YaqingLiu 7868563c2a Fixbug: ANNOVAR vor 3 Jahren
  YaqingLiu 33b1c80f3e test bam input vor 3 Jahren
  YaqingLiu cb2cc7173e test add bam vor 3 Jahren
  YaqingLiu fa7bbf3d1d Update: README vor 4 Jahren
  YaqingLiu 470d220762 Update: README vor 4 Jahren
  YaqingLiu 270b9d1ac0 Update: README vor 4 Jahren
  YaqingLiu 3960b57b2b Update: README vor 4 Jahren
  YaqingLiu 01d17edd41 Update: README vor 4 Jahren
  YaqingLiu 607454ab2f Update: add VEP vor 4 Jahren
  YaqingLiu dbd1da94c2 Update: add PASS filter option vor 4 Jahren
  YaqingLiu 3a2e5030af Update ANNOVAR.wdl filename vor 4 Jahren
  YaqingLiu d925a41571 Update: ANNOVAR vor 4 Jahren
  YaqingLiu fef526105b Add TNseq output vor 4 Jahren
  YaqingLiu 440fc0d224 Add annovar parameter vor 4 Jahren
  YaqingLiu ef82cc2a54 Fixbug: output of annovar vor 4 Jahren
  YaqingLiu a2064698dc Fixbug: output of annovar vor 4 Jahren
  YaqingLiu f3928d598e Update: default interval_padding is 0 vor 4 Jahren
  YaqingLiu 6d4d6abe80 Update: simplify BQSR vor 4 Jahren
  YaqingLiu eab87988a1 Alter: Varscan2 input is deduped BAM vor 4 Jahren
  YaqingLiu e8f07a8c53 Alter: TNseq input is deduped BAM vor 4 Jahren
  YaqingLiu d1faa18e02 Alter: TNseq Input vor 4 Jahren
  YaqingLiu 03fb6ee728 Update: defaults vor 4 Jahren
  YaqingLiu 568b2547c3 Update: defaults vor 4 Jahren