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更新 'tasks/qualimapBAMqc.wdl'

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chenqingwang 3 lat temu
rodzic
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8fbdae036c
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      tasks/qualimapBAMqc.wdl

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tasks/qualimapBAMqc.wdl Wyświetl plik

@@ -10,7 +10,7 @@ task qualimapBAMqc {
set -e
nt=$(nproc)
/opt/qualimap/qualimap bamqc -bam ${bam} -outformat PDF:HTML -nt $nt -outdir ${bamname}_bamqc --java-mem-size=32G
tar -zcvf ${bamname}_bamqc_qualimap.zip ${bamname}_bamqc
tar -zcvf ${bamname}_bamqc_qualimap.tar.gz ${bamname}_bamqc
>>>

@@ -22,7 +22,7 @@ task qualimapBAMqc {
}

output {
File bamqc_zip = "${bamname}_bamqc_qualimap.zip"
File bamqc_zip = "${bamname}_bamqc_qualimap.tar.gz"
}
}

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