YaqingLiu
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96 Révisions
1 Branche
Aborescence: 29053d0d19
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Créer la branche ${ searchTerm }
de '29053d0d19'
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Graphique des révisions

96 Révisions (29053d0d19e12add4842f87cb7cfb4a635c6effc)
 

Auteur SHA1 Message Date
  YaqingLiu 29053d0d19 Alter: replaceRG output il y a 3 ans
  YaqingLiu 7e4d99c1a7 Add: replaceRG il y a 3 ans
  YaqingLiu fe311d4483 Fixbug: remove il y a 3 ans
  YaqingLiu 6899365543 Fixbug: defaults il y a 3 ans
  YaqingLiu 212b5c40df Fixbug: TNseq output il y a 3 ans
  YaqingLiu fe6512cce0 Fixbug: TNseq output il y a 3 ans
  YaqingLiu 71cb524380 Fixbug: TNseq output il y a 3 ans
  YaqingLiu b124b6d8d0 Fixbug: TNseq il y a 3 ans
  YaqingLiu dbce0e5ce4 Alter: tumor-only il y a 3 ans
  YaqingLiu 55e4232daa Fixbug: input_fastq and input_bam il y a 3 ans
  YaqingLiu 831fa1b007 Alter: varscan_vep input name il y a 3 ans
  YaqingLiu 9a3ce1ee23 Alter: VEP task name il y a 3 ans
  YaqingLiu 9e1ac3e469 Alter: BQSR il y a 3 ans
  YaqingLiu 7868563c2a Fixbug: ANNOVAR il y a 3 ans
  YaqingLiu 33b1c80f3e test bam input il y a 3 ans
  YaqingLiu cb2cc7173e test add bam il y a 3 ans
  YaqingLiu fa7bbf3d1d Update: README il y a 4 ans
  YaqingLiu 470d220762 Update: README il y a 4 ans
  YaqingLiu 270b9d1ac0 Update: README il y a 4 ans
  YaqingLiu 3960b57b2b Update: README il y a 4 ans
  YaqingLiu 01d17edd41 Update: README il y a 4 ans
  YaqingLiu 607454ab2f Update: add VEP il y a 4 ans
  YaqingLiu dbd1da94c2 Update: add PASS filter option il y a 4 ans
  YaqingLiu 3a2e5030af Update ANNOVAR.wdl filename il y a 4 ans
  YaqingLiu d925a41571 Update: ANNOVAR il y a 4 ans
  YaqingLiu fef526105b Add TNseq output il y a 4 ans
  YaqingLiu 440fc0d224 Add annovar parameter il y a 4 ans
  YaqingLiu ef82cc2a54 Fixbug: output of annovar il y a 4 ans
  YaqingLiu a2064698dc Fixbug: output of annovar il y a 4 ans
  YaqingLiu f3928d598e Update: default interval_padding is 0 il y a 4 ans
  YaqingLiu 6d4d6abe80 Update: simplify BQSR il y a 4 ans
  YaqingLiu eab87988a1 Alter: Varscan2 input is deduped BAM il y a 4 ans
  YaqingLiu e8f07a8c53 Alter: TNseq input is deduped BAM il y a 4 ans
  YaqingLiu d1faa18e02 Alter: TNseq Input il y a 4 ans
  YaqingLiu 03fb6ee728 Update: defaults il y a 4 ans
  YaqingLiu 568b2547c3 Update: defaults il y a 4 ans
  YaqingLiu 7e612b6ddd Fix bug: merge Varscan's results il y a 4 ans
  YaqingLiu cb6332a576 Update: varscan somatic annovar il y a 4 ans
  YaqingLiu a06abfc5cf Update: varscan il y a 4 ans
  YaqingLiu 96a3c5dc5d Update: annovar.wdl, remove ensGene and knownGene il y a 4 ans
  YaqingLiu 09955be90c Update: default sentieon version il y a 4 ans
  YaqingLiu 61c1a9944f Update: README.md il y a 4 ans
  YaqingLiu 4c099f39b6 Update: README.md il y a 4 ans
  YaqingLiu d132679ec2 update default il y a 4 ans
  YaqingLiu 4ce53ad6c6 Fix bug: TNscope.wdl il y a 4 ans
  YaqingLiu af9561b1e0 Fix bug: BQSR.wdl il y a 4 ans
  YaqingLiu 59b2e9cb84 Fix bug: Realigner's inputs il y a 4 ans
  YaqingLiu ed468bfd8e Fix bug: TNseq.wdl il y a 4 ans
  YaqingLiu a6057601d2 Fix bug: BQSR.wdl il y a 4 ans
  YaqingLiu fe662a3686 Fix bug: TNseq.wdl il y a 4 ans