YaqingLiu
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PoN
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Generate the Panel of Normal files for TNseq and TNscope.
No puede seleccionar más de 25 temas Los temas deben comenzar con una letra o número, pueden incluir guiones ('-') y pueden tener hasta 35 caracteres de largo.
19 Commits
1 Rama
Árbol: fa91f6bae4
Ramas Etiquetas
${ item.name }
Crear rama ${ searchTerm }
desde 'fa91f6bae4'
${ noResults }
YaqingLiu fa91f6bae4 add realigner and bqsr hace 4 años
tasks add realigner and bqsr hace 4 años
.DS_Store Alter: test hace 4 años
README.md Add: mergePoN hace 4 años
defaults Alter: add bcftools_docker hace 4 años
inputs Alter: add bcftools_docker hace 4 años
workflow.wdl add realigner and bqsr hace 4 años

README.md

README.md

Author: Yaqing Liu

Email: yaqing.liu@outlook.com

Last Updates: 07/04/2021

Requirements

  • choppy
  • Ali-Cloud
  • Linux

Panel of Normals

The Panel of Normals approach uses a set of matched normal samples to determine the baseline level from which to call CNV events. These matched normal samples should be derived from the same library prep and sequencing workflow that was used for the case sample. This allows the algorithm to subtract out system level biases that are not sample specific.

Usage

```