YaqingLiu
/
PoN
Sledovat 1
Oblíbit 0
Rozštěpit 0
Zdrojový kód Úkoly 0 Požadavky na natažení 0 Vydání 0 Wiki Aktivita
Generate the Panel of Normal files for TNseq and TNscope.
Nelze vybrat více než 25 témat Téma musí začínat písmenem nebo číslem, může obsahovat pomlčky („-“) a může být dlouhé až 35 znaků.
19 Revize
1 Větev
Strom: fa91f6bae4
Větve Značky
${ item.name }
Vytvořit větev ${ searchTerm }
z „fa91f6bae4“
${ noResults }
YaqingLiu fa91f6bae4 add realigner and bqsr před 4 roky
tasks add realigner and bqsr před 4 roky
.DS_Store Alter: test před 4 roky
README.md Add: mergePoN před 4 roky
defaults Alter: add bcftools_docker před 4 roky
inputs Alter: add bcftools_docker před 4 roky
workflow.wdl add realigner and bqsr před 4 roky

README.md

README.md

Author: Yaqing Liu

Email: yaqing.liu@outlook.com

Last Updates: 07/04/2021

Requirements

  • choppy
  • Ali-Cloud
  • Linux

Panel of Normals

The Panel of Normals approach uses a set of matched normal samples to determine the baseline level from which to call CNV events. These matched normal samples should be derived from the same library prep and sequencing workflow that was used for the case sample. This allows the algorithm to subtract out system level biases that are not sample specific.

Usage

```