YaqingLiu
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PoN
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Generate the Panel of Normal files for TNseq and TNscope.
No puede seleccionar más de 25 temas Los temas deben comenzar con una letra o número, pueden incluir guiones ('-') y pueden tener hasta 35 caracteres de largo.
30 Commits
1 Rama
Árbol: bd4c35ef9e
Ramas Etiquetas
${ item.name }
Crear rama ${ searchTerm }
desde 'bd4c35ef9e'
${ noResults }
YaqingLiu bd4c35ef9e Fix bug: inputs hace 4 años
tasks Fix bug: tumor_sample parameter hace 4 años
.DS_Store Alter: test hace 4 años
README.md Add: mergePoN hace 4 años
defaults update input hace 4 años
inputs Fix bug: inputs hace 4 años
workflow.wdl Fix bug: tumor sample SM tag is not present in the bam file hace 4 años

README.md

README.md

Author: Yaqing Liu

Email: yaqing.liu@outlook.com

Last Updates: 07/04/2021

Requirements

  • choppy
  • Ali-Cloud
  • Linux

Panel of Normals

The Panel of Normals approach uses a set of matched normal samples to determine the baseline level from which to call CNV events. These matched normal samples should be derived from the same library prep and sequencing workflow that was used for the case sample. This allows the algorithm to subtract out system level biases that are not sample specific.

Usage

```