Bläddra i källkod

samtools task remove thread

master
junshang 4 år sedan
förälder
incheckning
44dd969877
1 ändrade filer med 2 tillägg och 2 borttagningar
  1. +2
    -2
      tasks/samtools.wdl

+ 2
- 2
tasks/samtools.wdl Visa fil

@@ -11,8 +11,8 @@ task samtools {
nt=$(nproc)
mkdir -p /cromwell_root/tmp/samtools
cd /cromwell_root/tmp/samtools
/opt/conda/bin/samtools -@ $nt index ${sep=' ' tumor_bam}
/opt/conda/bin/samtools -@ $nt index ${sep=' ' normal_bam}
/opt/conda/bin/samtools index ${sep=' ' tumor_bam}
/opt/conda/bin/samtools index ${sep=' ' normal_bam}
>>>

runtime {

Laddar…
Avbryt
Spara