Procházet zdrojové kódy

samtools task remove thread

master
junshang před 4 roky
rodič
revize
44dd969877
1 změnil soubory, kde provedl 2 přidání a 2 odebrání
  1. +2
    -2
      tasks/samtools.wdl

+ 2
- 2
tasks/samtools.wdl Zobrazit soubor

@@ -11,8 +11,8 @@ task samtools {
nt=$(nproc)
mkdir -p /cromwell_root/tmp/samtools
cd /cromwell_root/tmp/samtools
/opt/conda/bin/samtools -@ $nt index ${sep=' ' tumor_bam}
/opt/conda/bin/samtools -@ $nt index ${sep=' ' normal_bam}
/opt/conda/bin/samtools index ${sep=' ' tumor_bam}
/opt/conda/bin/samtools index ${sep=' ' normal_bam}
>>>

runtime {

Načítá se…
Zrušit
Uložit