renluyao
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variant-calling
geforkt von YaqingLiu/variant-calling
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100 Commits
1 Branch
Struktur: cd5f5ba56b
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Erstelle Branch ${ searchTerm }
von „cd5f5ba56b“
${ noResults }
Commit graph

49 Commits (cd5f5ba56b3f32cbff82c4e1c7d3b58d94a40324)

Autor SHA1 Nachricht Datum
  YaqingLiu cd5f5ba56b Fixbug: pindel task name vor 3 Jahren
  YaqingLiu a36b68f093 Fixbug: $ in pindel vor 3 Jahren
  YaqingLiu d2988bab5d Fixbug: cluster: cluster_config vor 3 Jahren
  YaqingLiu 29053d0d19 Alter: replaceRG output vor 3 Jahren
  YaqingLiu 7e4d99c1a7 Add: replaceRG vor 3 Jahren
  YaqingLiu fe311d4483 Fixbug: remove vor 3 Jahren
  YaqingLiu 212b5c40df Fixbug: TNseq output vor 3 Jahren
  YaqingLiu fe6512cce0 Fixbug: TNseq output vor 3 Jahren
  YaqingLiu 71cb524380 Fixbug: TNseq output vor 3 Jahren
  YaqingLiu b124b6d8d0 Fixbug: TNseq vor 3 Jahren
  YaqingLiu dbce0e5ce4 Alter: tumor-only vor 3 Jahren
  YaqingLiu 9a3ce1ee23 Alter: VEP task name vor 3 Jahren
  YaqingLiu 9e1ac3e469 Alter: BQSR vor 3 Jahren
  YaqingLiu 7868563c2a Fixbug: ANNOVAR vor 3 Jahren
  YaqingLiu 607454ab2f Update: add VEP vor 4 Jahren
  YaqingLiu dbd1da94c2 Update: add PASS filter option vor 4 Jahren
  YaqingLiu 3a2e5030af Update ANNOVAR.wdl filename vor 4 Jahren
  YaqingLiu d925a41571 Update: ANNOVAR vor 4 Jahren
  YaqingLiu fef526105b Add TNseq output vor 4 Jahren
  YaqingLiu 440fc0d224 Add annovar parameter vor 4 Jahren
  YaqingLiu a2064698dc Fixbug: output of annovar vor 4 Jahren
  YaqingLiu 6d4d6abe80 Update: simplify BQSR vor 4 Jahren
  YaqingLiu e8f07a8c53 Alter: TNseq input is deduped BAM vor 4 Jahren
  YaqingLiu d1faa18e02 Alter: TNseq Input vor 4 Jahren
  YaqingLiu 03fb6ee728 Update: defaults vor 4 Jahren
  YaqingLiu 7e612b6ddd Fix bug: merge Varscan's results vor 4 Jahren
  YaqingLiu cb6332a576 Update: varscan somatic annovar vor 4 Jahren
  YaqingLiu a06abfc5cf Update: varscan vor 4 Jahren
  YaqingLiu 96a3c5dc5d Update: annovar.wdl, remove ensGene and knownGene vor 4 Jahren
  YaqingLiu 4ce53ad6c6 Fix bug: TNscope.wdl vor 4 Jahren
  YaqingLiu af9561b1e0 Fix bug: BQSR.wdl vor 4 Jahren
  YaqingLiu ed468bfd8e Fix bug: TNseq.wdl vor 4 Jahren
  YaqingLiu a6057601d2 Fix bug: BQSR.wdl vor 4 Jahren
  YaqingLiu fe662a3686 Fix bug: TNseq.wdl vor 4 Jahren
  YaqingLiu 09159a19f9 Update: README.md vor 4 Jahren
  YaqingLiu 693a6bc34b Fix bug: Haplotyper vor 4 Jahren
  YaqingLiu eb14b9b267 Update: inputs vor 4 Jahren
  YaqingLiu d73e139d63 Update: inputs vor 4 Jahren
  YaqingLiu 51f177520c Update: README.md vor 4 Jahren
  YaqingLiu 24df48e237 Update: TNseq.wdl vor 4 Jahren
  YaqingLiu 0c11f3af3f Update: TNscope.wdl vor 4 Jahren
  YaqingLiu 2958e946a7 Update: README.md vor 4 Jahren
  YaqingLiu 91f18eb183 Remove corealigner and vcf2maf vor 4 Jahren
  YaqingLiu 5189a041e6 Update: README.md vor 4 Jahren
  YaqingLiu bc00d0efe5 Update: README.md vor 4 Jahren
  YaqingLiu b76c7f072f Update: deduped_Matrics vor 4 Jahren
  YaqingLiu 031f11adde Fix Bug: input vor 4 Jahren
  YaqingLiu 2cf4efbe99 alter workflow parameters vor 4 Jahren
  YaqingLiu b9b58e0480 first commit vor 4 Jahren