室间质评
Du kan inte välja fler än 25 ämnen Ämnen måste starta med en bokstav eller siffra, kan innehålla bindestreck ('-') och vara max 35 tecken långa.
LUYAO REN 74696f3fb4 add jaccard index 5 år sedan
pictures first commit 5 år sedan
tasks add jaccard index 5 år sedan
README.md output of bamqc to multiqc 5 år sedan
Report.md first commit 5 år sedan
fastq_screen.conf first commit 5 år sedan
inputSamplesFileExamples.tsv first commit 5 år sedan
inputs jaccard index 5 år sedan
workflow.wdl add jaccard index 5 år sedan

README.md

中华家系1号标准物质室间质评报告系统分析流程

1. 中华家系1号标准物质介绍

2. 分析流程图

3. 各模块运行流程

准备inputSamplesFIle (tsv格式)

#fastq_read1	#fastq_read2	#bam	#bai	#vcf	#sample_mark

(1) fastqc

(2) fastqscreen

(3) qualimap

(4) benchmarking (hap.py)

(5) multiqc

(6) VcfStats

注:可查询multiqc支持的指控模块,按需求添加 https://multiqc.info/docs/#multiqc-modules