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il y a 5 ans | |
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pictures | il y a 5 ans | |
tasks | il y a 5 ans | |
README.md | il y a 5 ans | |
Report.md | il y a 5 ans | |
fastq_screen.conf | il y a 5 ans | |
inputSamplesFileExamples.tsv | il y a 5 ans | |
inputs | il y a 5 ans | |
workflow.wdl | il y a 5 ans |
准备inputSamplesFIle (tsv格式)
#fastq_read1 #fastq_read2 #bam #bai #vcf #sample_mark
(1) fastqc
(2) fastqscreen
(3) qualimap
(4) benchmarking (hap.py)
(5) multiqc
(6) VcfStats
注:可查询multiqc支持的指控模块,按需求添加 https://multiqc.info/docs/#multiqc-modules