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6年前 | |
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pictures | 6年前 | |
tasks | 6年前 | |
README.md | 6年前 | |
Report.md | 6年前 | |
fastq_screen.conf | 6年前 | |
inputSamplesFileExamples.tsv | 6年前 | |
inputs | 6年前 | |
workflow.wdl | 6年前 |
准备inputSamplesFIle (tsv格式)
#fastq_read1 #fastq_read2 #bam #bai #vcf #sample_mark
(1) fastqc
(2) fastqscreen
(3) qualimap
(4) benchmarking (hap.py)
(5) multiqc
(6) VcfStats
注:可查询multiqc支持的指控模块,按需求添加 https://multiqc.info/docs/#multiqc-modules