|
5 jaren geleden | |
---|---|---|
pictures | 5 jaren geleden | |
tasks | 5 jaren geleden | |
README.md | 5 jaren geleden | |
Report.md | 5 jaren geleden | |
fastq_screen.conf | 5 jaren geleden | |
inputSamplesFileExamples.tsv | 5 jaren geleden | |
inputs | 5 jaren geleden | |
workflow.wdl | 5 jaren geleden |
准备inputSamplesFIle (tsv格式)
#fastq_read1 #fastq_read2 #bam #bai #vcf #sample_mark
(1) fastqc
(2) fastqscreen
(3) qualimap
(4) benchmarking (hap.py)
(5) multiqc
(6) VcfStats
注:可查询multiqc支持的指控模块,按需求添加 https://multiqc.info/docs/#multiqc-modules