bcftools-merge is used to merge VCF files into a singe VCF.
Du kan inte välja fler än 25 ämnen Ämnen måste starta med en bokstav eller siffra, kan innehålla bindestreck ('-') och vara max 35 tecken långa.
YaqingLiu 3ad726fb45 test input 4 år sedan
tasks fix bug 4 år sedan
.DS_Store first commit 5 år sedan
LICENSE.md first commit 5 år sedan
README.md test input 4 år sedan
defaults fix bug 4 år sedan
inputs test input 4 år sedan
workflow.wdl fix bug 4 år sedan

README.md

Usage

$ open-choppy-env $ choppy install YaqingLiu/bcftools

Input File

Input file should be in the form of json. For example:

{
	"vcf": [
          "oss://choppy-cromwell-result/test-choppy/..._pon.vcf",
          "oss://choppy-cromwell-result/test-choppy/..._pon.vcf",
          "oss://choppy-cromwell-result/test-choppy/..._pon.vcf"
        ],
	"sample_id": "somatic_normal"
}