bcftools-merge is used to merge VCF files into a singe VCF.
Nevar pievienot vairāk kā 25 tēmas Tēmai ir jāsākas ar burtu vai ciparu, tā var saturēt domu zīmes ('-') un var būt līdz 35 simboliem gara.
YaqingLiu 3ad726fb45 test input pirms 4 gadiem
tasks fix bug pirms 4 gadiem
.DS_Store first commit pirms 5 gadiem
LICENSE.md first commit pirms 5 gadiem
README.md test input pirms 4 gadiem
defaults fix bug pirms 4 gadiem
inputs test input pirms 4 gadiem
workflow.wdl fix bug pirms 4 gadiem

README.md

Usage

$ open-choppy-env $ choppy install YaqingLiu/bcftools

Input File

Input file should be in the form of json. For example:

{
	"vcf": [
          "oss://choppy-cromwell-result/test-choppy/..._pon.vcf",
          "oss://choppy-cromwell-result/test-choppy/..._pon.vcf",
          "oss://choppy-cromwell-result/test-choppy/..._pon.vcf"
        ],
	"sample_id": "somatic_normal"
}