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feat: tnscope min_base_qual

master
YaqingLiu 2 년 전
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@@ -54,6 +54,7 @@ task TNscope {
--algo TNscope \
$SAMPLE \
--dbsnp ${dbsnp_dir}/${dbsnp} \
--min_base_qual 20 \
${sample}.TNscope.vcf
# awk -F'\t' '{if(($1~"^#")||($1!~"^#" && $7=="PASS")){print $0}}' ${sample}.TNscope.vcf > ${sample}.TNscope.PASS.vcf

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