Procházet zdrojové kódy

feat: tnscope min_base_qual

master
YaqingLiu před 2 roky
rodič
revize
f5dd691db8
1 změnil soubory, kde provedl 1 přidání a 0 odebrání
  1. +1
    -0
      tasks/TNscope.wdl

+ 1
- 0
tasks/TNscope.wdl Zobrazit soubor

@@ -54,6 +54,7 @@ task TNscope {
--algo TNscope \
$SAMPLE \
--dbsnp ${dbsnp_dir}/${dbsnp} \
--min_base_qual 20 \
${sample}.TNscope.vcf
# awk -F'\t' '{if(($1~"^#")||($1!~"^#" && $7=="PASS")){print $0}}' ${sample}.TNscope.vcf > ${sample}.TNscope.PASS.vcf

Načítá se…
Zrušit
Uložit