Bläddra i källkod

feat: tnscope min_base_qual

master
YaqingLiu 2 år sedan
förälder
incheckning
e2f604839f
1 ändrade filer med 0 tillägg och 1 borttagningar
  1. +0
    -1
      tasks/TNscope.wdl

+ 0
- 1
tasks/TNscope.wdl Visa fil

@@ -54,7 +54,6 @@ task TNscope {
--algo TNscope \
$SAMPLE \
--dbsnp ${dbsnp_dir}/${dbsnp} \
--min_base_qual 20 \
${sample}.TNscope.vcf
# awk -F'\t' '{if(($1~"^#")||($1!~"^#" && $7=="PASS")){print $0}}' ${sample}.TNscope.vcf > ${sample}.TNscope.PASS.vcf

Laddar…
Avbryt
Spara