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fix(TMB): size
master
YaqingLiu
vor 2 Jahren
Ursprung
0a4135befb
Commit
da3f7cd4cd
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tasks/TMB.wdl
+ 1
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tasks/TMB.wdl
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@@ -16,7 +16,7 @@ task TMB {
size=`awk -F'\t' 'BEGIN{SUM=0}{SUM+=$3-$2}END{print SUM}' merged.bed`
# analysis in python
python ~/tmb.py ${snpindel_txt} $
{
size
}
${sample}
python ~/tmb.py ${snpindel_txt} $size ${sample}
>>>
runtime {
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