Kaynağa Gözat

fix(TMB): size

master
YaqingLiu 2 yıl önce
ebeveyn
işleme
da3f7cd4cd
1 değiştirilmiş dosya ile 1 ekleme ve 1 silme
  1. +1
    -1
      tasks/TMB.wdl

+ 1
- 1
tasks/TMB.wdl Dosyayı Görüntüle

size=`awk -F'\t' 'BEGIN{SUM=0}{SUM+=$3-$2}END{print SUM}' merged.bed` size=`awk -F'\t' 'BEGIN{SUM=0}{SUM+=$3-$2}END{print SUM}' merged.bed`
# analysis in python # analysis in python
python ~/tmb.py ${snpindel_txt} ${size} ${sample}
python ~/tmb.py ${snpindel_txt} $size ${sample}
>>> >>>
runtime { runtime {

Yükleniyor…
İptal
Kaydet