2 измененных файлов: 2 добавлений и 0 удалений
+ 1
- 0
tasks/MSIsensor.wdl
Просмотреть файл
| task MSIsensor { | task MSIsensor { | ||||
| String sample | |||||
| File ref_dir | File ref_dir | ||||
| String fasta | String fasta | ||||
| File tumor_bam | File tumor_bam |
+ 1
- 0
workflow.wdl
Просмотреть файл
| call MSIsensor.MSIsensor as MSIsensor { | call MSIsensor.MSIsensor as MSIsensor { | ||||
| input: | input: | ||||
| sample=sample_id, | |||||
| fasta=fasta, | fasta=fasta, | ||||
| ref_dir=ref_dir, | ref_dir=ref_dir, | ||||
| normal_bam=normal_BQSR.recaled_bam, | normal_bam=normal_BQSR.recaled_bam, |
Загрузка…