2 fichiers modifiés avec 2 ajouts et 0 suppressions
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tasks/MSIsensor.wdl
Voir le fichier
| @@ -1,5 +1,6 @@ | |||
| task MSIsensor { | |||
| String sample | |||
| File ref_dir | |||
| String fasta | |||
| File tumor_bam | |||
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workflow.wdl
Voir le fichier
| @@ -294,6 +294,7 @@ workflow {{ project_name }} { | |||
| call MSIsensor.MSIsensor as MSIsensor { | |||
| input: | |||
| sample=sample_id, | |||
| fasta=fasta, | |||
| ref_dir=ref_dir, | |||
| normal_bam=normal_BQSR.recaled_bam, | |||
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