Przeglądaj źródła

fix: annovar operation

master
YaqingLiu 2 lat temu
rodzic
commit
f2584245d9
1 zmienionych plików z 1 dodań i 1 usunięć
  1. +1
    -1
      tasks/ANNOVAR.wdl

+ 1
- 1
tasks/ANNOVAR.wdl Wyświetl plik

@@ -16,7 +16,7 @@ task ANNOVAR {
${annovar_database} -buildver hg19 \
-out ${basename} -remove \
-protocol refGene,cytoBand,genomicSuperDups,clinvar_20220320,intervar_20180118,cosmic95_coding,cosmic95_noncoding,avsnp150 \
-operation g,r,r,f,f,f,f,f,f,f \
-operation g,r,r,f,f,f,f,f \
-nastring . -vcfinput -polish -thread $nt
# gnomad211_exome,dbnsfp42c,
>>>

Ładowanie…
Anuluj
Zapisz