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fix: annovar operation

master
YaqingLiu hace 2 años
padre
commit
f2584245d9
Se han modificado 1 ficheros con 1 adiciones y 1 borrados
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      tasks/ANNOVAR.wdl

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tasks/ANNOVAR.wdl Ver fichero

@@ -16,7 +16,7 @@ task ANNOVAR {
${annovar_database} -buildver hg19 \
-out ${basename} -remove \
-protocol refGene,cytoBand,genomicSuperDups,clinvar_20220320,intervar_20180118,cosmic95_coding,cosmic95_noncoding,avsnp150 \
-operation g,r,r,f,f,f,f,f,f,f \
-operation g,r,r,f,f,f,f,f \
-nastring . -vcfinput -polish -thread $nt
# gnomad211_exome,dbnsfp42c,
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