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fix: annovar operation

master
YaqingLiu il y a 2 ans
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révision
f2584245d9
1 fichiers modifiés avec 1 ajouts et 1 suppressions
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      tasks/ANNOVAR.wdl

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tasks/ANNOVAR.wdl Voir le fichier

@@ -16,7 +16,7 @@ task ANNOVAR {
${annovar_database} -buildver hg19 \
-out ${basename} -remove \
-protocol refGene,cytoBand,genomicSuperDups,clinvar_20220320,intervar_20180118,cosmic95_coding,cosmic95_noncoding,avsnp150 \
-operation g,r,r,f,f,f,f,f,f,f \
-operation g,r,r,f,f,f,f,f \
-nastring . -vcfinput -polish -thread $nt
# gnomad211_exome,dbnsfp42c,
>>>

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