3 измењених фајлова са 3 додато и 3 уклоњено
+ 1
- 1
tasks/BQSR.wdl
Прегледај датотеку
| String cluster_config | String cluster_config | ||||
| String disk_size | String disk_size | ||||
| String sample=basename(realigned_bam, ".*") | |||||
| String sample=basename(realigned_bam, ".sorted.deduped.realigned.bam") | |||||
| command <<< | command <<< | ||||
| set -o pipefail | set -o pipefail |
+ 1
- 1
tasks/PoN.wdl
Прегледај датотеку
| String cluster_config | String cluster_config | ||||
| String disk_size | String disk_size | ||||
| String sample=basename(normal_bam, ".*") | |||||
| String sample=basename(normal_bam, ".sorted.deduped.realigned.recaled.bam") | |||||
| command <<< | command <<< | ||||
| set -o pipefail | set -o pipefail |
+ 1
- 1
tasks/Realigner.wdl
Прегледај датотеку
| String cluster_config | String cluster_config | ||||
| String disk_size | String disk_size | ||||
| String sample=basename(deduped_bam, ".*") | |||||
| String sample=basename(deduped_bam, ".sorted.deduped.bam") | |||||
| command <<< | command <<< | ||||
| set -o pipefail | set -o pipefail |
Loading…