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variant-calling
forkeado de YaqingLiu/variant-calling
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129 Commits
1 Rama
Rama: master
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Gráfico de commits

129 Commits (master)
 

Autor SHA1 Mensaje Fecha
  renluyao 4ddc424595 Update 'workflow.wdl' hace 3 años
  renluyao 8f6edd7278 Update 'workflow.wdl' hace 3 años
  renluyao 99f70b99c0 Update 'workflow.wdl' hace 3 años
  renluyao 403df4530c Update 'workflow.wdl' hace 3 años
  renluyao ad55a9a349 Update 'workflow.wdl' hace 3 años
  YaqingLiu f4c1c1aba5 Update: sample_id in Haplotyper and Pindel hace 3 años
  YaqingLiu f02a98c73b Update: remove # line hace 3 años
  YaqingLiu cd2666a59f Update: VEP ncbi_build hace 3 años
  YaqingLiu 6d752761a9 Update: VEP ncbi_build hace 3 años
  YaqingLiu af15b0f88c Update: VEP hace 3 años
  YaqingLiu 0b9bcc926f Update: VEP and ANNOVAR hace 3 años
  YaqingLiu c59e589713 Update: java Xmx32g hace 3 años
  YaqingLiu df1c66f195 Update: remove only_pass hace 3 años
  YaqingLiu e8269dd25f Update: annovar hace 3 años
  YaqingLiu d7acaa8040 Update: replaceRG hace 3 años
  YaqingLiu aea00bb6e0 Update: README hace 3 años
  YaqingLiu 1819c0a4f6 Update: threads in Pindel hace 3 años
  YaqingLiu af26391dd8 Fixbug: insert size in Pindel hace 3 años
  YaqingLiu 024d9b4281 update README hace 3 años
  YaqingLiu 3accc366b6 update workflow hace 3 años
  YaqingLiu f4279ccb13 Update: workflow operator hace 3 años
  YaqingLiu d064f8f055 Update: workflow hace 3 años
  YaqingLiu 4975096286 Alter varscan Xmx16g hace 3 años
  YaqingLiu 13bc0462c9 Update: samtools dir hace 3 años
  YaqingLiu 56f48cd21f Update: samtools_docker version hace 3 años
  YaqingLiu 61ae02ea72 Update: samtools_docker version hace 3 años
  YaqingLiu f515625972 Fixbug: samtools index hace 3 años
  YaqingLiu c72f3aae8c Fixbug: replaceRG input hace 3 años
  YaqingLiu 5e46d8aee0 Fixbug: task's name hace 3 años
  YaqingLiu cd5f5ba56b Fixbug: pindel task name hace 3 años
  YaqingLiu 19a6548af2 Fixbug: add pindel Boolean hace 3 años
  YaqingLiu a36b68f093 Fixbug: $ in pindel hace 3 años
  YaqingLiu d2988bab5d Fixbug: cluster: cluster_config hace 3 años
  YaqingLiu 29053d0d19 Alter: replaceRG output hace 3 años
  YaqingLiu 7e4d99c1a7 Add: replaceRG hace 3 años
  YaqingLiu fe311d4483 Fixbug: remove hace 3 años
  YaqingLiu 6899365543 Fixbug: defaults hace 3 años
  YaqingLiu 212b5c40df Fixbug: TNseq output hace 3 años
  YaqingLiu fe6512cce0 Fixbug: TNseq output hace 3 años
  YaqingLiu 71cb524380 Fixbug: TNseq output hace 3 años
  YaqingLiu b124b6d8d0 Fixbug: TNseq hace 3 años
  YaqingLiu dbce0e5ce4 Alter: tumor-only hace 3 años
  YaqingLiu 55e4232daa Fixbug: input_fastq and input_bam hace 3 años
  YaqingLiu 831fa1b007 Alter: varscan_vep input name hace 3 años
  YaqingLiu 9a3ce1ee23 Alter: VEP task name hace 3 años
  YaqingLiu 9e1ac3e469 Alter: BQSR hace 3 años
  YaqingLiu 7868563c2a Fixbug: ANNOVAR hace 3 años
  YaqingLiu 33b1c80f3e test bam input hace 3 años
  YaqingLiu cb2cc7173e test add bam hace 3 años
  YaqingLiu fa7bbf3d1d Update: README hace 4 años