LUYAO REN пре 5 година
родитељ
комит
b7933eb1b1
1 измењених фајлова са 4 додато и 4 уклоњено
  1. +4
    -4
      tasks/mergeSentieon.wdl

+ 4
- 4
tasks/mergeSentieon.wdl Прегледај датотеку

@@ -18,10 +18,10 @@ task mergeSentieon {
command <<<
set -o pipefail
set -e
cat ${aln_metrics_header} | sed -n '1,1p' | cat - ${sep=" " aln_metrics_data} > aln_metrics.txt
cat ${dedup_metrics_header} | sed -n '1,1p' | cat - ${sep=" " dedup_metrics_data} > dedup_metrics.txt
cat ${is_metrics_header} | sed -n '1,1p' | cat - ${sep=" " is_metrics_data} > is_metrics.txt
cat ${deduped_coverage_header} | sed -n '1,1p' | cat - ${sep=" " deduped_coverage_data} > deduped_coverage.txt
cat ${sep=" " aln_metrics_header} | sed -n '1,1p' | cat - ${sep=" " aln_metrics_data} > aln_metrics.txt
cat ${sep=" " dedup_metrics_header} | sed -n '1,1p' | cat - ${sep=" " dedup_metrics_data} > dedup_metrics.txt
cat ${sep=" " is_metrics_header} | sed -n '1,1p' | cat - ${sep=" " is_metrics_data} > is_metrics.txt
cat ${sep=" " deduped_coverage_header} | sed -n '1,1p' | cat - ${sep=" " deduped_coverage_data} > deduped_coverage.txt
>>>

runtime {

Loading…
Откажи
Сачувај