Просмотр исходного кода

sister and family seprate

master
LUYAO REN 5 лет назад
Родитель
Сommit
559b7494a2
1 измененных файлов: 1 добавлений и 1 удалений
  1. +1
    -1
      tasks/sister.wdl

+ 1
- 1
tasks/sister.wdl Просмотреть файл

@@ -12,7 +12,7 @@ task sister {
export LD_LIBRARY_PATH=/opt/htslib-1.9

mkdir sister
vbt varcomp -called ${LCL5_vcf} -base ${LCL6_vcf} -ref ${ref_dir}/${fasta} -outDir sister -filter none
/opt/VBT-TrioAnalysis/vbt varcomp -called ${LCL5_vcf} -base ${LCL6_vcf} -ref ${ref_dir}/${fasta} -outDir sister -filter none

mv sister/TPBase.vcf ${family_name}.sister.consistent.vcf
mv sister/FP.vcf ${family_name}.LCL5.uniq.vcf

Загрузка…
Отмена
Сохранить