Pārlūkot izejas kodu

更新 'tasks/TNscope.wdl'

master
meng pirms 2 gadiem
vecāks
revīzija
b8ad83311e
1 mainītis faili ar 2 papildinājumiem un 1 dzēšanām
  1. +2
    -1
      tasks/TNscope.wdl

+ 2
- 1
tasks/TNscope.wdl Parādīt failu

@@ -31,9 +31,10 @@ task sentieon_TNscope{
-i ${tumor_bam} -q ${tumor_recall_data} \
-i ${normal_bam} -q ${normal_recall_data} \
--algo TNscope --tumor_sample ${tumor_name} --normal_sample ${normal_name} \
--disable_detector sv --trim_soft_clip \
--trim_soft_clip \
--dbsnp ${dbsnp_dir}/${dbsnp} ${sample_id}.TNscope.vcf || { echo "TNscope failed"; exit 1; }
# --disable_detector sv
ls ./

>>>

Notiek ielāde…
Atcelt
Saglabāt