Procházet zdrojové kódy

更新 'tasks/rmats.wdl'

tags/v4.1.1
chenqingwang před 4 roky
rodič
revize
bbc3934184
1 změnil soubory, kde provedl 2 přidání a 1 odebrání
  1. +2
    -1
      tasks/rmats.wdl

+ 2
- 1
tasks/rmats.wdl Zobrazit soubor

@@ -1,6 +1,6 @@
task rmats {
String sample_id
File b1_txt_file
File b1_txt_file ## 阿里云不能直接读取txt内容,要建立阿里云和服务器的联系(read_csv)
Array[Array[File]] b1_txt = read_csv(b1_txt_file)
File b2_txt_file
Array[Array[File]] b2_txt = read_csv(b2_txt_file)
@@ -19,6 +19,7 @@ task rmats {

mkdir -p ${sample_id}/output
mkdir -p ${sample_id}/tmp_output
### 命令行无需修改
python /usr/local/bin/rmats.py --b1 ${b1_txt} \
--b2 ${b2_txt} \
--gtf ${reference_gtf_file} \

Načítá se…
Zrušit
Uložit