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chenhaonan
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quartet_dna_quality_control_wgs_big_pipeline
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renluyao/quartet_dna_quality_control_wgs_big_pipeline
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test06
tags/v0.3.0
Haonan917
1 anno fa
parent
100cdbbd0e
commit
3102050ad8
2 ha cambiato i file
con
499 aggiunte
e
499 eliminazioni
Visualizzazione separata
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+1
-1
tasks/Haplotyper.wdl
+498
-498
workflow.wdl
+ 1
- 1
tasks/Haplotyper.wdl
Vedi File
@@ -18,7 +18,7 @@ command <<<
--output_vcf=${sample}_hc.vcf \
--num_shards=$(nproc)
gatk IndexFeatureFile -I ${sample}_hc.vcf -O ${sample}_hc.vcf.idx
/opt/gatk-4.4/
gatk IndexFeatureFile -I ${sample}_hc.vcf -O ${sample}_hc.vcf.idx
>>>
runtime {
+ 498
- 498
workflow.wdl
File diff soppresso perché troppo grande
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