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test06

tags/v0.3.0
Haonan917 1 anno fa
parent
commit
3102050ad8
2 ha cambiato i file con 499 aggiunte e 499 eliminazioni
  1. +1
    -1
      tasks/Haplotyper.wdl
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    -498
      workflow.wdl

+ 1
- 1
tasks/Haplotyper.wdl Vedi File

@@ -18,7 +18,7 @@ command <<<
--output_vcf=${sample}_hc.vcf \
--num_shards=$(nproc)
gatk IndexFeatureFile -I ${sample}_hc.vcf -O ${sample}_hc.vcf.idx
/opt/gatk-4.4/gatk IndexFeatureFile -I ${sample}_hc.vcf -O ${sample}_hc.vcf.idx
>>>
runtime {

+ 498
- 498
workflow.wdl
File diff soppresso perché troppo grande
Vedi File


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