Haonan917 преди 1 година
родител
ревизия
3102050ad8
променени са 2 файла, в които са добавени 499 реда и са изтрити 499 реда
  1. +1
    -1
      tasks/Haplotyper.wdl
  2. +498
    -498
      workflow.wdl

+ 1
- 1
tasks/Haplotyper.wdl Целия файл

@@ -18,7 +18,7 @@ command <<<
--output_vcf=${sample}_hc.vcf \
--num_shards=$(nproc)
gatk IndexFeatureFile -I ${sample}_hc.vcf -O ${sample}_hc.vcf.idx
/opt/gatk-4.4/gatk IndexFeatureFile -I ${sample}_hc.vcf -O ${sample}_hc.vcf.idx
>>>
runtime {

+ 498
- 498
workflow.wdl
Файловите разлики са ограничени, защото са твърде много
Целия файл


Loading…
Отказ
Запис