ソースを参照

fix bug

master
YaqingLiu 4年前
コミット
54d9bd85a9
1個のファイルの変更1行の追加1行の削除
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      tasks/picard.wdl

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tasks/picard.wdl ファイルの表示

@@ -14,7 +14,7 @@ task picard {
set -o pipefail
set -e
nt=$(nproc)
java -jar /usr/bin/picard/picard.jar LiftoverVcf -I ${vcf} -O ${sample}_picard.vcf -REJECT rejected_variants.vcf -CHAIN ${chain_dir}/${chain} -R ${ref_dir}/${fasta}
java -jar /usr/bin/picard/picard.jar LiftoverVcf I=${vcf} O=${sample}_picard.vcf REJECT=rejected_variants.vcf CHAIN=${chain_dir}/${chain} R=${ref_dir}/${fasta}
>>>
runtime {

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