променени са 2 файла, в които са добавени 0 реда и са изтрити 3 реда
+ 0
- 1
tasks/bedtools.wdl
Целия файл
| task bedtools { | task bedtools { | ||||
| Array[File] bam | Array[File] bam | ||||
| Array[File] bai | |||||
| File bed_file | File bed_file | ||||
| String docker | String docker |
+ 0
- 2
workflow.wdl
Целия файл
| File bed_file | File bed_file | ||||
| Array[Array[File]] input_samples = read_tsv(input_samples_file) | Array[Array[File]] input_samples = read_tsv(input_samples_file) | ||||
| Array[File] bam = input_samples[0] | Array[File] bam = input_samples[0] | ||||
| Array[File] bai = input_samples[1] | |||||
| call bedtools.bedtools as bedtools { | call bedtools.bedtools as bedtools { | ||||
| input: | input: | ||||
| bam=bam, | bam=bam, | ||||
| bai=bai, | |||||
| bed_file=bed_file | bed_file=bed_file | ||||
| } | } |
Loading…