2 fichiers modifiés avec 0 ajouts et 3 suppressions
+ 0
- 1
tasks/bedtools.wdl
Voir le fichier
| @@ -1,7 +1,6 @@ | |||
| task bedtools { | |||
| Array[File] bam | |||
| Array[File] bai | |||
| File bed_file | |||
| String docker | |||
+ 0
- 2
workflow.wdl
Voir le fichier
| @@ -6,11 +6,9 @@ workflow {{ project_name }} { | |||
| File bed_file | |||
| Array[Array[File]] input_samples = read_tsv(input_samples_file) | |||
| Array[File] bam = input_samples[0] | |||
| Array[File] bai = input_samples[1] | |||
| call bedtools.bedtools as bedtools { | |||
| input: | |||
| bam=bam, | |||
| bai=bai, | |||
| bed_file=bed_file | |||
| } | |||
Chargement…