Procházet zdrojové kódy

[Fix Bug] Cannot find the multiqc command.

tags/v0.1.2
YJC před 3 roky
rodič
revize
c835f2c492
1 změnil soubory, kde provedl 2 přidání a 1 odebrání
  1. +2
    -1
      src/tservice/plugins/merge_rnaseq_expression.clj

+ 2
- 1
src/tservice/plugins/merge_rnaseq_expression.clj Zobrazit soubor

@@ -145,7 +145,8 @@
(gen-multiqc-config config)
(doseq [file (fs-api/batch-filter-files multiqc-dir [".*bamqc_qualimap.tar.gz" ".*RNAseq_qualimap.tar.gz"])]
(decompression-tar file))
(let [multiqc-result (mq/multiqc multiqc-dir dest-dir {:title "MultiQC Report" :template "default" :config config})
(let [multiqc-result (mq/multiqc multiqc-dir dest-dir {:title "MultiQC Report" :template "default"
:config config :env {:PATH (add-env-to-path "merge-rnaseq-expression")}})
result {:status (:status multiqc-result)
:msg (:msg multiqc-result)}
log (json/write-str result)]

Načítá se…
Zrušit
Uložit