renluyao
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variant-calling
geforkt von YaqingLiu/variant-calling
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82 Commits
1 Branch
Struktur: 33b1c80f3e
Branches Tags
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Erstelle Branch ${ searchTerm }
von „33b1c80f3e“
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Commit graph

35 Commits (33b1c80f3ea942c78da641ba956342ad061163d0)

Autor SHA1 Nachricht Datum
  YaqingLiu 33b1c80f3e test bam input vor 3 Jahren
  YaqingLiu cb2cc7173e test add bam vor 3 Jahren
  YaqingLiu 607454ab2f Update: add VEP vor 4 Jahren
  YaqingLiu dbd1da94c2 Update: add PASS filter option vor 4 Jahren
  YaqingLiu d925a41571 Update: ANNOVAR vor 4 Jahren
  YaqingLiu 440fc0d224 Add annovar parameter vor 4 Jahren
  YaqingLiu ef82cc2a54 Fixbug: output of annovar vor 4 Jahren
  YaqingLiu eab87988a1 Alter: Varscan2 input is deduped BAM vor 4 Jahren
  YaqingLiu e8f07a8c53 Alter: TNseq input is deduped BAM vor 4 Jahren
  YaqingLiu d1faa18e02 Alter: TNseq Input vor 4 Jahren
  YaqingLiu cb6332a576 Update: varscan somatic annovar vor 4 Jahren
  YaqingLiu a06abfc5cf Update: varscan vor 4 Jahren
  YaqingLiu 4ce53ad6c6 Fix bug: TNscope.wdl vor 4 Jahren
  YaqingLiu 59b2e9cb84 Fix bug: Realigner's inputs vor 4 Jahren
  YaqingLiu ed468bfd8e Fix bug: TNseq.wdl vor 4 Jahren
  YaqingLiu a6057601d2 Fix bug: BQSR.wdl vor 4 Jahren
  YaqingLiu ab4b741af9 Fix bug: germline vor 4 Jahren
  YaqingLiu 784f19e2c9 Fix bug: remove vcf2maf vor 4 Jahren
  YaqingLiu 02f79915c3 Fix bug: remove vcf2maf vor 4 Jahren
  YaqingLiu 193d7a3bf4 Update: inputs vor 4 Jahren
  YaqingLiu 979513f14c Update: inputs vor 4 Jahren
  YaqingLiu 1dd6c6016d Update: inputs vor 4 Jahren
  YaqingLiu 340692e44a Update: inputs vor 4 Jahren
  YaqingLiu eb14b9b267 Update: inputs vor 4 Jahren
  YaqingLiu d73e139d63 Update: inputs vor 4 Jahren
  YaqingLiu 51f177520c Update: README.md vor 4 Jahren
  YaqingLiu 24df48e237 Update: TNseq.wdl vor 4 Jahren
  YaqingLiu 0c11f3af3f Update: TNscope.wdl vor 4 Jahren
  YaqingLiu 91f18eb183 Remove corealigner and vcf2maf vor 4 Jahren
  YaqingLiu 5189a041e6 Update: README.md vor 4 Jahren
  YaqingLiu bc00d0efe5 Update: README.md vor 4 Jahren
  YaqingLiu 031f11adde Fix Bug: input vor 4 Jahren
  YaqingLiu 73ec3f4522 alter workflow parameters vor 4 Jahren
  YaqingLiu 78ecea16ce alter workflow parameters vor 4 Jahren
  YaqingLiu b9b58e0480 first commit vor 4 Jahren